首先更正一下。应该是小肠镜检查吧！
小肠镜检查是由口腔→食道→胃镜→十二指肠→小肠,放入一条内视镜,以检查小肠是否有病变的情形。
小肠镜检查主要是对原因不明消化道出血，小肠血管畸形，克隆氏病，小肠造影有异常，慢性腹病，疑有小肠器质病变，多发性息肉症候群，小肠肿瘤以及不明原因体重减轻的病人，经胃镜及大肠镜检查未发现阳性病变的疑难病人，用该项检查以明确诊断。
至于治疗手段，要等到检查出结果后，再对症制定诊断方案。
小肠胶囊也就是胶囊内镜检查，尽管小肠镜检查技术已取得了长足的进展，由于小肠特殊的部位和长度，内镜插入困难，小肠疾病的检测仍存在不少盲区，同时部分患者也难以耐受小肠镜的检查，小肠疾病的诊断一直是临床的难点. 而胶囊内镜不仅能达到目前内镜普遍难以到达的小肠位置，而且可获得清晰的图像，只是无法象常规内镜那样通过调节角度钮仔细观察病灶，亦不能获得活组织标本，不能作病理学检查，而且费用相对较高.
胶囊内镜的适应证有：曾接受过传统检查仍无法解释的消化道出血; 肠源性的腹痛、腹泻; 炎症性肠病; 血管畸形; 肠营养吸收不良等疾病。
这两种检查各有优缺点，上面已经说得比较清楚，可根据医生的指导意见确定使用。